Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms