Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms