Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT3P49368 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms