Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms