Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV4P43268 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV4P43268 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms