Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC1A2P43004 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms