Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms