Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms