Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA1P29973 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms