Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP1P29466 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms