Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARID4AP29374 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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