Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTGFP29279 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTGFP29279 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTGFP29279 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTGFP29279 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms