Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRMP28827 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRMP28827 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
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