Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms