Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PLNP26678 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PLNP26678 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms