Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms