Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APCP25054 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APCP25054 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APCP25054 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
APCP25054 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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