Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSHP23434 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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GCSHP23434 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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GCSHP23434 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSHP23434 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GCSHP23434 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GCSHP23434 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GCSHP23434 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GCSHP23434 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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