Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms