Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF3P18847 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms