Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPI1P17947 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPI1P17947 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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