Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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