Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB1P16220 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms