Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSP16219 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACADSP16219 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACADSP16219 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACADSP16219 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms