Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms