Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMDP11532 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DMDP11532 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DMDP11532 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DMDP11532 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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