Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms