Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RARBP10826 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RARBP10826 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RARBP10826 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RARBP10826 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARBP10826 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARBP10826 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms