Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2F1P10589 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms