Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI3P10071 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI3P10071 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms