Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2AF1L5P0DN76 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2AF1L5P0DN76 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms