Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms