Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms