Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPBP07199 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPBP07199 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms