Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms