Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SCN2BO60939 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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