Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms