Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRTM2O43300 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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