Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP290O15078 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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CEP290O15078 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP290O15078 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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