Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRTO14522 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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