Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCRL2O00421 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCRL2O00421 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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