Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms