Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC169A6NNP5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms