Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms