Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms