Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RCE1Q9Y256 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RCE1Q9Y256 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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