Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms