Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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COPS3Q9UNS2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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