Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNRF3Q9ULT6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms