Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms